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miRNA定量及均一化cDNA文库技术

发布时间:2019-06-25 20:30:33

导语 miRNA定量   进行一次逆转录即可实现所有目标miRNA的测定?没错,采用加尾法,一次逆转录就可以得到全部miRNA对应的cDNA。   我们知道,真核生物mRNA都是有poly-A尾巴的,这样Oligo-dT(逆转录引

       miRNA定量

 

    进行一次逆转录即可实现所有目标miRNA的测定?没错,采用加尾法,一次逆转录就可以得到全部miRNA对应的cDNA。

 

  我们知道,真核生物mRNA都是有poly-A尾巴的,这样Oligo-dT(逆转录引物)就很容易结合到mRNA上来合成cDNA了。

 

  miRNA就缺了poly-A尾巴,怎么办呢?在逆转录试剂盒中加入poly-A聚合酶,先给它们加上一串poly-A尾巴,然后用带有一段通用序列的Oligo-dT和逆转录酶来合成cDNA。这样一来,一次逆转录反应就合成了所有miRNA以及其他snRNA、mRNA对应的cDNA,接下来想用来检测什么都可以!

 

  您只需要提供1μg合格的total RNA,就可以对所有感兴趣的miRNA进行检测。这既可避免茎环法(各目标miRNA单独逆转录)带来的逆转录效率、加样误差等方面的影响,还可节约多条特异逆转录引物和多次逆转录反应的花费,可谓一举两得,何乐而不为?

 

  均一化cDNA文库

 

  基因转录水平上的巨大差异常常给文库筛选和 分析 带来障碍,采用均一化文库技术可有效克服这一问题。 均一化 cDNA 文库具有以下4方面的优点:第一,在经济上具有广泛的应用空间,可以节约大量试验成本。第二,增加克隆低丰度 mRNA 的机会,适用于 分析 各种发育阶段或各种组织的基因表达及突变检测。第三,与原始丰度的 mRNA 拷贝数相对应的 cDNA 探针与均一化的 cDNA 文库作杂交,可以估计出大多数基因的表达水平及发现一些组织特异的基因。而以往的文库构建,忽略了 mRNA 丰度的影响。第四,可以用于遗传图谱的制作和进行大规模的原位杂交,作为优化的文库系统还可以用于大规模的测序。

 

  现在,在构建均一化的cDNA 文库中至少有2种主要的观点:一种是基于复性动力学的原理,高丰度的cDNA 在退火条件下复性的速度快,而低丰度的cDNA 复性要很长时间,从而可以通过控制复性时间来降低丰度;另一种是基于基因组 DNA 在拷贝数上具有相对均一化的性质,通过cDNA 与基因组DNA 饱和杂交而降低在文库中高拷贝存在的cDNA 的丰度。第一种方法的掌握对技术的要求比较高,对多数人而言需要多次摸索才能找到最适条件;而后一种方法易于掌握,但有 研究 者根据复性动力学的原理也提出了其不利因素,即采用基因组DNA 饱和杂交的方法会因为低拷贝的表达基因拷贝数少而无法被杂交上。

 

  DSN  是最近发现的一种热稳定核酸酶。该酶能够选择性降解双链DNA 和DNARNA杂交体中的DNA,对单链核酸分子几乎没有作用。同目前常用的均一化技术相比,基于DSN 的均一化技术操作步骤简单, 所需要的起始材料也比较少, 具有较好的应用前景。

 

  上海欧易生物医学科技有限公司开展miRNA定量检测服务已经近三年时间,服务项目几百个。拥有自己的miRNA引物库(人类),对其他物种可以自行设计引物,检测样品范围广,包括:细胞、组织、血液、血浆、血清、细胞培养上清等,操作规范,时间可控,为广大 研究 工作者提供了良好的便利。

 

  同时,其作为国内cDNA文库构建的主流服务供应商,在长期稳定的实验服务过程中积累了丰富的经验,已经成功构建包括动物、植物、细菌等几十个物种的cDNA文库。他们基于双链特异性核酸酶的先进cDNA文库均一化技术,能减低高丰度表达基因100倍以上,有效富集低丰度表达基因,从而降低冗余率。

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